湖南疾控已完成20例新冠病毒標本測序:均為德爾塔毒株 與南京高度同源

2021年08月02日12:05

  原標題:新湖南獨家丨湖南疾控已完成20例新冠病毒標本測序,均為德爾塔毒株,與南京高度同源

  來源:湖南日報·新湖南客戶端

  湖南日報·新湖南客戶端8月2日訊 (記者 張春祥 通訊員 張亞娜 李世康) 記者今日獲悉,自7月28日拿到我省2021年第一例本土新冠肺炎病例標本以來,湖南省疾控中心已完成20例德爾塔新冠病毒基因組測序。已經完成測序結果的標本均為德爾塔毒株,與南京高度同源。

  5天時間已完成20例標本測序

  據省疾控中心檢驗科科長湛誌飛介紹,基因組測序可在第一時間獲取新發未知病毒的基因組序列信息,已成為研究疾病暴發的重要工具。通過構建進化樹,研究不同患者病毒遺傳序列變化,能在分子生物學層面揭示病毒的傳播方式,分析新冠病毒的進化來源,研究新冠病毒的致病病理機製,為控製疫情暴發提供科學依據。

  通過檢測新冠病毒的全基因組序列,再將這個序列通過算法與數據庫中的數據進行比對,可以初步判斷其地域來源。將序列與既往病例序列進行比對,如果序列在同一進化樹分支上,則可以判斷這些病例是否來自同一傳播鏈或傳染源。

  面對此次疫情,從7月28日拿到湖南省2021年第一例本土新冠肺炎病例標本以來,湖南省疾控已完成20例標本測序。

  24小時完成病毒基因測序溯源

  “新冠病毒樣本送到實驗室後,一般需要經過多個步驟完成檢測。”湛誌飛稱,在接到陽性樣本後,工作人員首先進行複核工作,對樣本進行核酸提取,再用兩種試劑進行核酸檢測。複核陽性的標本,分別用二代和三代高通量測序技術進行序列測定,為病毒溯源工作設置“雙保險”,確保萬無一失。

  病毒基因序列測定完成後,工作人員還要馬上進行生物信息學分析,將病毒序列與數據庫中的序列進行比對,查看有無變異位點,進行同源性比較。完成數據比對後,還要及時撰寫溯源報告。

  “目前,湖南省疾控中心已具備新冠病毒基因組高通量二代和三代測序能力,為湖南省新型冠狀病毒疫情以及其他傳染病病原體的鑒定和溯源、防控應對提供了強大的技術支撐。”湛誌飛介紹,去年10月份才掌握這項技術,以前都是送到國家疾控中心檢測。目前湖南省疾控中心培養了3名技術骨幹,所有的新冠病毒基因組測序都能在24小時內完成,情況複雜的也不會超過48小時。根據疫情的變化,只要有標本來,都會在24小時內啟動測序流程。

  測序結果與南京高度同源

  7月28日,接到2021年第一例本土新冠肺炎病例標本測序工作以來,省疾控中心立即組織專業技術人員,日夜不停地開展測序工作,通過文庫製備、簇生成、上機測序與數據比對分析,已經完成測序結果的標本均為德爾塔毒株。從國家疾控中心反饋的結果顯示,和江蘇省報送的南京疫情本土病例新冠病毒基因組序列高度同源。

  根據最新疫情通報,2021年7月20日0時至8月1日24時,湖南省累計報告新型冠狀病毒肺炎確診病例22例。此次疫情病原體為德爾塔變異株,範圍廣、來勢猛,廣大民眾一定不能掉以輕心,嚴格執行好持碼進出、測量體溫、佩戴口罩、保持距離等措施,有效降低病毒傳播風險,減少不必要的人員聚集。

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