深圳華大海洋領銜構建出魚類“生命之樹”
2018年05月17日21:38

原標題:深圳華大海洋領銜構建出魚類“生命之樹”

  中新社深圳5月17日電 (記者 鄭小紅)記者17日從深圳華大海洋獲悉,由華大海洋和國家基因庫聯合發起的“千種魚類轉錄組”(Fish―T1K)項目已宣佈構建了迄今為止最可靠的魚類系統演化樹,該成果發表於最新一期的《美國科學院院刊》,為物種多樣性及瀕危物種的保護提供科學的指導意見,也有助開展海洋生態環境保護、經濟物種的繁育等研究。

  共同參與這一工作的還有美國喬治華盛頓大學、史密森尼博物院以及新加坡科技研究局。

  據介紹,作為進化地位古老且物種多樣性豐富的脊椎動物類群,魚類的物種數量占所有脊椎動物的一半以上,目前已發現的魚類至少33900種。

  此次Fish―T1K團隊從整個魚類的不同分類單元中精心挑選了303種魚類物種,包括硬骨魚72個目中的66個,占總分類單元的91.66%。大數據整合了144種魚類的基因組數據和159種魚類的轉錄組數據,採用新的生物信息學分析方法,篩選出1105個直系同源的外顯子序列作為分子標記,構建了迄今為止最可靠的魚類系統演化樹。

  該“生命之樹”解決了許多一直以來飽受爭議的魚類分類單元進化問題,涉及硬骨魚的原始起源類群、骨鰾總目和銀漢魚總目的演化,以及真骨魚、棘鰭總目、鱸形總目的姐妹群歸屬等問題,還顯示現存的絕大部分魚類類群早在白堊紀末期之前就已經形成,其中最早出現的類群起源於3.79億年前。

  Fish―T1K項目成立於2013年11月,旨在完成1000種魚類的轉錄組測序和分析,解密魚類起源、進化、生殖、發育、免疫等多方面的科學問題。目前,該項目已成功吸引了來自7個國家的20多家科研機構參與,完成了200多種硬骨魚類物種的轉錄組測序和組裝,成功構建了全球首個大規模的魚類轉錄組數據庫,為魚類基礎科研和應用研究提供大數據支撐。(完)

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